MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC2

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012795	ACT	2	6	44	49	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012795	T	6	6	65	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012795	A	7	7	192	198	100 %	0 %	0 %	0 %	239828746
4	NC_012795	CAT	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828746
5	NC_012795	GAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828746
6	NC_012795	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828746
7	NC_012795	TCA	2	6	439	444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828746
8	NC_012795	TTA	2	6	580	585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828746
9	NC_012795	CAAA	2	8	619	626	75 %	0 %	0 %	25 %	239828746
10	NC_012795	T	6	6	640	645	0 %	100 %	0 %	0 %	239828746
11	NC_012795	TTA	2	6	653	658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828746
12	NC_012795	TTG	2	6	707	712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828746
13	NC_012795	CAA	3	9	740	748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828746
14	NC_012795	CAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828746
15	NC_012795	GA	4	8	786	793	50 %	0 %	50 %	0 %	239828746
16	NC_012795	CAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828746
17	NC_012795	TTG	2	6	866	871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828746
18	NC_012795	CAG	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828747
19	NC_012795	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828747
20	NC_012795	AT	3	6	1006	1011	50 %	50 %	0 %	0 %	239828747
21	NC_012795	GCA	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828747
22	NC_012795	A	6	6	1036	1041	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
23	NC_012795	GT	3	6	1042	1047	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
24	NC_012795	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
25	NC_012795	GT	3	6	1159	1164	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
26	NC_012795	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828747
27	NC_012795	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	239828747
28	NC_012795	A	6	6	1267	1272	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
29	NC_012795	A	7	7	1291	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
30	NC_012795	ATA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828747
31	NC_012795	ATG	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828747
32	NC_012795	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828747
33	NC_012795	ACC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828747
34	NC_012795	GGT	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828747
35	NC_012795	GACA	2	8	1456	1463	50 %	0 %	25 %	25 %	239828747
36	NC_012795	GT	3	6	1480	1485	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
37	NC_012795	AGAT	2	8	1501	1508	50 %	25 %	25 %	0 %	239828747
38	NC_012795	AGA	2	6	1509	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828747
39	NC_012795	ATCT	3	12	1522	1533	25 %	50 %	0 %	25 %	239828747
40	NC_012795	CT	3	6	1532	1537	0 %	50 %	0 %	50 %	239828747
41	NC_012795	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
42	NC_012795	GAT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828747
43	NC_012795	GAAGCG	2	12	1824	1835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	239828747
44	NC_012795	TGC	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828747
45	NC_012795	A	6	6	1965	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
46	NC_012795	GGAA	2	8	1975	1982	50 %	0 %	50 %	0 %	239828747
47	NC_012795	CCCTG	2	10	2060	2069	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_012795	T	6	6	2121	2126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012795	TATT	2	8	2179	2186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012795	T	7	7	2189	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012795	A	7	7	2281	2287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012795	GA	3	6	2320	2325	50 %	0 %	50 %	0 %	239828748
53	NC_012795	A	6	6	2408	2413	100 %	0 %	0 %	0 %	239828748
54	NC_012795	GTTTA	2	10	2436	2445	20 %	60 %	20 %	0 %	239828748
55	NC_012795	CAATT	2	10	2458	2467	40 %	40 %	0 %	20 %	239828748
56	NC_012795	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828748
57	NC_012795	GAT	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828748
58	NC_012795	AGAA	2	8	2567	2574	75 %	0 %	25 %	0 %	239828748
59	NC_012795	A	6	6	2573	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	239828748
60	NC_012795	CTG	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828748
61	NC_012795	GCAA	2	8	2626	2633	50 %	0 %	25 %	25 %	239828748
62	NC_012795	TA	3	6	2723	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	239828748
63	NC_012795	GTG	3	9	2976	2984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828748
64	NC_012795	TTTA	2	8	3096	3103	25 %	75 %	0 %	0 %	239828749
65	NC_012795	A	8	8	3168	3175	100 %	0 %	0 %	0 %	239828749
66	NC_012795	ATC	2	6	3282	3287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828749
67	NC_012795	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828749
68	NC_012795	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828749
69	NC_012795	T	7	7	3473	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	239828749
70	NC_012795	AAT	2	6	3498	3503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828749
71	NC_012795	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828749
72	NC_012795	TGC	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828749
73	NC_012795	GCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828749
74	NC_012795	CAG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828749
75	NC_012795	TAG	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828749
76	NC_012795	TCT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828749
77	NC_012795	TTG	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828749
78	NC_012795	GGAT	2	8	3879	3886	25 %	25 %	50 %	0 %	239828749
79	NC_012795	GGT	2	6	3943	3948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012795	AAG	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012795	A	7	7	4132	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012795	ATG	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012795	GGT	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012795	GCA	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012795	GCA	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012795	TAGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012795	TGT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
88	NC_012795	GCT	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828750
89	NC_012795	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	239828750
90	NC_012795	AAGC	2	8	4574	4581	50 %	0 %	25 %	25 %	239828750
91	NC_012795	TAA	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
92	NC_012795	AT	3	6	4780	4785	50 %	50 %	0 %	0 %	239828750
93	NC_012795	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828750
94	NC_012795	ATG	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828750
95	NC_012795	TC	3	6	4846	4851	0 %	50 %	0 %	50 %	239828750
96	NC_012795	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
97	NC_012795	A	6	6	4941	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	239828750
98	NC_012795	TTG	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
99	NC_012795	T	6	6	4988	4993	0 %	100 %	0 %	0 %	239828750
100	NC_012795	AAT	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
101	NC_012795	TGT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
102	NC_012795	TTGT	2	8	5116	5123	0 %	75 %	25 %	0 %	239828750
103	NC_012795	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828750
104	NC_012795	TA	3	6	5163	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	239828750
105	NC_012795	T	6	6	5230	5235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012795	T	6	6	5320	5325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012795	TTC	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012795	TTC	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012795	CTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012795	ATC	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012795	GTA	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012795	CTTT	2	8	5466	5473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012795	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012795	AATT	2	8	5560	5567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012795	TCATGT	2	12	5585	5596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012795	TAT	2	6	5627	5632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012795	ACAAAT	2	12	5640	5651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_012795	A	6	6	5670	5675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012795	A	8	8	5689	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012795	GTTT	2	8	5778	5785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012795	T	7	7	5810	5816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012795	AAC	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012795	TGA	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828751
124	NC_012795	TTTG	2	8	5946	5953	0 %	75 %	25 %	0 %	239828751
125	NC_012795	TTA	2	6	5968	5973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828751
126	NC_012795	ATG	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828751
127	NC_012795	T	6	6	6139	6144	0 %	100 %	0 %	0 %	239828751
128	NC_012795	A	6	6	6219	6224	100 %	0 %	0 %	0 %	239828751
129	NC_012795	AAAATA	2	12	6241	6252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	239828751
130	NC_012795	AAAG	2	8	6266	6273	75 %	0 %	25 %	0 %	239828751
131	NC_012795	TGC	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012795	AAT	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012795	TTTTG	2	10	6385	6394	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012795	TCTTAC	2	12	6424	6435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012795	T	6	6	6462	6467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012795	A	6	6	6473	6478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012795	T	8	8	6524	6531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012795	A	6	6	6554	6559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012795	ACA	2	6	6573	6578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828752
140	NC_012795	CAA	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828752
141	NC_012795	A	6	6	6635	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
142	NC_012795	A	6	6	6654	6659	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.